当原体走到皇宫门口时，迎接他的是帝皇的严厉斥责。帝皇以从未有过的严厉语气斥责原体忘记了银河中斗争的残酷性，并让他跪倒在永恒之门前的纪念广场上为每一个因为自己“指挥失当”丧失生命的战士忏悔。
通常而言，帝皇对自己的这些超人子嗣并不会使用太严厉的态度，除非像罗嘉.奥瑞利安那样极大忤逆了大远征计划的原体。而对于第二军团原体这个一直与帝皇亦父亦友的原体这种态度更是从未出现过。帝皇在称呼中不再使用原体的名字，甚至连“儿子”的称呼也不曾出现，却使用了表达陌生态度的“第二号基因原体”，这让在场禁军不由生出些许诧异。看着帝皇的态度，泪流满面跪在牺牲将士纪念碑前的原体甚至一度以为下一秒帝皇就会命令禁军当场逮捕自己。
但这一切始终没有发生。当原体抬起头时，怒火中烧的帝皇已经不见了踪影，帝国宰相马卡多则向他宣布了帝国和帝皇的裁决：第二军团将被流放到帝国边疆之外甚至银河之外，进行一次“赎罪远征”。
原体失魂落魄的回到了自己的战舰上，帝国政务院将进一步的命令送到了原体手上。第二军团被命令在自己的母星上休整一年之后要立刻启程。而原体能带走的部队也不是军团的全部——当时军团剩余的部队中，有大概三分之一正在银河各处执行着各种作战或者建设任务，来不及在一年之内赶回母星。根据帝国政务厅的命令，这些部队从此将脱离第二军团编制，由各军团就近接手（其中大多被第七军团和第十三军团接纳，这对原体和军团来说是个相对较好的结局）。
第二条命令则让人有些摸不清头脑。帝国授予了第二军团开发未知星球、可以在帝国边疆星域中征兵、征集资源和收缴什一税（不得超过帝国官方税额）的权力。并允许军团募集平民参与远征。
第三条命令是：目前在第二军团远征队中的其它军团人员将作为代表和证人参加第二军团的远征。
对于这个命令，军团上下非常抵触。在他们看来：这是帝国对自己摆在明面上的不信任。他也有一些人自我安慰：其它军团的人员是作为证人和代表而非监军参加本次远征，这说明帝国和帝皇并对军团还没有彻底的丧失信心，他们依旧是一支被信任的部队。
然而这个幻想在远征即将开始前一个泰拉月被彻底打破：一支禁军百人队和两个寂静修女中队被作为监视者派到了军团远征舰队，这样赤裸裸的不信任几乎让军团士气跌入谷底。但好在不论是禁军还是寂静修女都很清楚自己的责任，对军团表示了一定程度的善意，并表示：除非与自己的任务相悖，他们在远征中将服从原体的命令。至于他们的命令是什么，这些战士三缄其口，坚决拒绝回答。
远征的准备工作是在一片沉闷和低落的环境中完成的。唯一的好消息是，军团人员虽然低落，但到底没有绝望，所有的命令都被一丝不苟的执行着，直到最后的远征日到来。
随着远征日的到来，军团舰队告别了母星，告别了帝国，告别了自己熟知的银河。母星人民拖家带口前来送别舰队，一如他们之前每一次送别。还不知道内情的母星人民欢呼着向舰队和穿梭机抛洒鲜花，仿佛期待着这些自己的勇士在不久的将来就能凯旋归来，这让军团所有人的心都沉重无比：所有人都知道，这些人注定看不到自己归来了，而自己也
注定再也看不到母星——这是一场不知道时间、不知道前路的远征，即使是阿斯塔特，也不能保证自己一定能活着等到归期。
看着舷窗中逐渐远去的星球，舰队中上至原体，下至底层船舱的船工，所有人都望向了自己对母星唯一的牵挂——在自己的怀中一小袋来自母星的尘土。远征舰队中所有人都达成了一致：在远征途中不幸去世的人将被烧成骨灰统一保管，不论远征持续多少年，都要让活着的人带回家乡。
远征的前十年，远征军笼罩在一片愁云惨淡中。
被帝国放逐的屈辱、再也回不去母星的哀愁以及未知前路的惶恐让远征军的士气长时间在谷底徘徊。舰队在这十年中处理了上万起自杀事件，其中甚至包括了一名阿斯塔特老兵。
最终这种惶恐情绪发展到高潮是一次异形劫掠事件。在这次恶劣的事件中，一整个连队的阿斯塔特几乎是坐视一艘运输平民的船只被异形的掠夺舰船俘虏。要不是帝国之拳随同远征的部队及时发现并碶而不舍的发起了几乎是自杀式的攻击夺回了舰船，船上的平民恐怕将凶多吉少。
消息传到军团指挥部，所有人都被这一恶劣事件所震惊——这是第二军团建军史上的绝对污点。任谁都没有想到一向以保护帝国人民为己任的军团竟然能出现坐视帝国人民被异形劫掠的事件。
军团指挥部所有人特别是政治导师群体要求原体立刻对这个连队处以极刑，用他们的鲜血为自己的行为赎罪。特别是考虑到此时远征舰队已经处于帝国边疆之外，不对纪律进行严肃处理后果将不堪设想，甚至有可能导致军团的分崩离析。原体思考后否决了这一建议，并命令将这个连队所有人都禁闭起来，等待处理。一时间，原体想要对这些子嗣网开一面的传闻喧嚣尘上，整个舰队的氛围也开始变得奇怪了起来。
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